█ 組織架構

• 電機工程系 主要內容為培養學生具備「武器系統」之基本理論，據此設計電機工程、電子電路、控制理論、信號處理及微波通訊系統等課程與相關實驗課程，使學生有良好的電機專業基礎，以便在學習海軍武器系統時有所助益，並增進其爾後發展之潛力。
• 海洋科學系 主要在培養學生瞭解海軍所賴以生存的海洋環境，充實海洋相關方面之科學知識，期日後能依據海洋環境即時條件做通盤考量，充分掌握戰術及武器運用時機，於戰場上獲致成功。
• 船舶機械系 主要教學宗旨，在於教導學生艦船結構、動力系統、艦船機電控制及流體力學等相關課程之基本原理，期使學生能具備船舶專業知識，深入了解艦船裝備運作原理，在畢業後能勝任艦艇工作，達成培育艦艇優秀專業軍官之目地。
• 應用科學系 設立宗旨是培養具備「科學素養」與「海軍科技」基本理論與實務的海軍初官。藉傳授以基礎科學為主體之教育，使學生在航輪兼修之餘，進一步瞭解科學與技術的本質、海軍與科技之關係，奠定日後在海軍職場勝任職務與將來終身學習發展之基礎。
• 資訊管理系 本系教育宗旨，在於期望同學在海軍官校航輪兼習的通才教育環境中，同時能接受到良好的管理及資訊基礎教育，並為未來服務海軍或赴研究所深造奠下良好的根基。
• 應用外語系 民國94年7月1日因應教學部組織調整，成立通識教育中心，係合併原外文系與文史系成人文組，另政治系成為社會組。為提升本軍語文能力，結合建構「固若磐石」國防武力、招生暨專業師資培育三項重要的軍事教育任務，民國108年7月1日成立「應用外語系」，成為本校一般學科部的新設之第六個專業學系，將人文國際化深入科學工程與管理專技專業的現代化海軍初級軍官。