行政編組組織系統 第一層 校長 第二層 教育長、政戰主任、士官督導長室 第三層 教務處、總務處、學員生事務處、學生總隊部、主計室、資圖中心、勤務隊、醫務所
教育編組組織系統 第一層 校長 第二層 教育長、政戰主任、教育諮詢委員會、教育委員會、課程設計委員會 第三層 一般學科部下有電機工程學系、船舶機械學系、海洋科學學系、資訊管理學系、應用科學學系 總教官室下有戰術組、輪機組、體育組 通識教育中心
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