寒暑訓
軍事教育為軍校辦學之特色，亦為本校完整教育中的重要一環，本校軍事教育採統整軍事領域教學之方式實施，由海軍人文科學教育起步，其次接受電力、電機工程 等基礎理論及海洋環境、航輪進階等課程，最後完成兵器、戰鬥、動力系統、水中聲學、海洋氣象等全般海軍科技知識的深度學習，教育期程劃分階段性目標，並配合軍事訓練整體設計，實施泳訓、廠訓、艦訓及新四項訓練等軍事訓練。
正期班
一年級： 培養團隊精神、加強體能、磨練意志及毅力，使其對艦艇有一初步瞭解。
二年級與三年級：加強軍事航輪理論與實務之結合。
四年級： 建立軍事本職專業，並於遠航期間完成艙面、輪機航行副值更官專業簽證。
陸戰組與航空組：學生於第2學年課程結束後，依成績實施海軍組、陸戰組之選組作業；經選組後為陸戰組之學生，於第2、3學年暑訓期間赴陸戰隊學校進訓，航空組學生赴反潛航空大隊進訓。
二年級與三年級：加強軍事航輪理論與實務之結合。
四年級： 建立軍事本職專業，並於遠航期間完成艙面、輪機航行副值更官專業簽證。
陸戰組與航空組：學生於第2學年課程結束後，依成績實施海軍組、陸戰組之選組作業；經選組後為陸戰組之學生，於第2、3學年暑訓期間赴陸戰隊學校進訓，航空組學生赴反潛航空大隊進訓。
士官二專班
暑期訓練：除入伍訓練外，各年級依本軍特性分別實施游泳訓練、廠訓、新四項訓練、分科實習及環島航訓，使學理與實務相互印證，達成畢業後勝任本職工作。
